[Proga_Boinc]

BOINC client 7.24.1 Обсуждение

Краткое описание:
Программа-клиент для распределенных вычислений.

Описание:

Используйте свой смартфон или планшет для изучения болезней, предсказания глобального потепления, обнаружения пульсаров и не только! BOINC использует незадействованные вычислительные ресурсы устройства Android и выполняет задания для научно-исследовательских проектов. Вы можете выбрать из нескольких проектов в различных областях науки, например такие как Yoyo@Home, World Community Grid, PrimeGrid, Enigma@Home, OProject@Home, theSkyNet POGS, Asteroids@Home, Einstein@Home и Quake-Catcher Network.

Откуда приходят задания и кому это нужно

Создать проект на платформе BOINC может любой желающий — вся платформа BOINC изначально разрабатывалась в рамках LGPL, поэтому любой может ознакомиться с исходными текстами. В основном этим занимаются различные университеты и научные центры для решения задач, требующих больших вычислительных ресурсов, но не имеющих необходимых материальных средств для покупки суперкомпьютеров, либо мощностей современных суперкомпьютеров недостаточно для решения поставленной задачи.

Какой проект чем занимается(взято с Википедии)

Сама ссылка на страничку в Википедии: BOINC
SETI@home — анализ радиосигналов с радиотелескопа Аресибо, а также ряда других радиотелескопов мира, для поиска внеземных цивилизаций.
World Community Grid — помощь в поиске лекарств для лечения человеческих заболеваний, таких как рак, ВИЧ/СПИД, расчёт структуры белков и другие проекты.
Einstein@Home — проверка гипотезы Альберта Эйнштейна о гравитационных волнах, а также поиск радио- и гамма-пульсаров.
PrimeGrid — поиск различных больших простых чисел.
theSkyNet POGS — построение спектрального атласа ближайшей части Вселенной в области длин волн от ближнего инфракрасного излучения до ультрафиолета по данным GALEX, Pan-STARRS и WISE.
OProject@Home — анализ алгоритмов, доказательство проблемы Гольдбаха.
Asteroids@Home — определение формы и параметров вращения астероидов по данным фотометрических наблюдений.
Quake-Catcher Network — Обнаружение распространения сейсмических волн.
GPUGrid.net — проект, организованный университетом Помпеу Фабра. Проект занимается полно-атомным моделированием молекулярной биологии.
Rosetta@home — вычисление 3-мерной структуры белков из их аминокислотных последовательностей.
Так же там есть возможность добавить менеджер проектов BAM, GridRepublic, Extremeadurathome.

BOINC по умолчанию выполняет расчёты только когда устройство подключено и заряжено, поэтому BOINC не разряжает аккумулятор. Данные передаются через Wi-Fi, поэтому лимиты тарифного плана по передаче данных вашего смартфона не будут превышены. Кроме Wi-Fi можно передавать и по обычному интернету(2g/3g/4g). Имеет очень гибкие настройки(в настройках отметьте пункт "Показать дополнительные настройки и элементы управления").

Требуется Android: 4.1 и выше
Русский интерфейс: Частично

Разработчик: Space Sciences Laboratory, U.C. Berkeley
Домашняя страница: http://boinc.berkeley.edu/
Google Play: https://play.google.com/store/apps/d...berkeley.boinc

Доступна новая версия BOINC (7.24.1).

Описание последней версии
Изменения в версии 7.24.1

Улучшена реализация регулировки процессора значение по умолчанию для настройки «suspend_if_no_recent_input» равно 0, а не 60 если запланированный запрос не удался, укажите URL-адрес планировщика (это может быть проблемой).
Показывать предупреждение, если время простоя для возобновления вычислений превышает время простоя для приостановки вычислений.
Игнорировать старые настройки, отправленные проектами или AM избегайте перепланирования процессоров при наличии заданий MT
Диспетчер: ошибка в диалоговом окне вычислений настроек
Менеджер: добавьте кнопку в журнал событий, чтобы отображать только оповещения (ошибки).
Менеджер: улучшение согласованности контрольных меток и ускорителей.
Менеджер: показывать родные названия для языковых вариантов и только тех, для которых доступны переводы.
Android: в случае приостановки из-за перегрева или зарядки аккумулятора не возобновляйте работу в течение как минимум 5 минут.
Mac: поддержка темного режима в расширенном просмотре
Mac: добавлен стандартный ярлык команды-запятой для пункта меню «Настройки».

(Release notes for the BOINC Client:
Changes in 7.24.1
 improve implementation of CPU throttling
 the default value for the "suspend_if_no_recent_input" pref is 0, not 60
 if sched request fails, show the scheduler URL (that might be the problem)
 Show alert if idle time to resume computing is greater than idle time to suspend computing
 ignore old prefs sent by projects or AM
 avoid overscheduling CPUs in presence of MT jobs
 Manager: computing prefs dialog bug
 Manager: Add button in event log to display only alerts (errors)
 Manager: Improve consistency of control labels and accelerators
 Manager: Show native names for language options, and only those for which translations are available
 Android: if suspend because of battery heat or charge, don't resume for at least 5 minutes.
 Mac: Support Dark Mode in Advanced View
 Mac: Add standard command-comma shortcut for Preferences menu item)

Добавлено через 17 часов 56 минут
Новые приложения OpenCL для графических процессоров AMD в проекте Asteroids@home!

https://asteroidsathome.net/boinc/fo...ead.php?id=967

Всем привет,

Мы с гордостью представляем наши новые приложения OpenCL для графических процессоров AMD!

Процесс разработки занял некоторое время, но нам наконец удалось его построить. Нам еще предстоит доработать много недоработок, но благодаря вам, ребята, и вашим отзывам мы продолжим улучшать код.

Для приложения Linux требуется 64-битная ОС с GLIBC v2.31 или выше, и оно будет работать на большинстве графических карт AMD Radeon и некоторых интегрированных графических процессорах AMD с поддержкой OpenCL 1.1 или выше.

Для приложения Windows требуется 64-битная версия Windows 10 или 11, и оно будет работать на большинстве карт AMD Radeon и некоторых интегрированных графических процессорах AMD с поддержкой OpenCL 1.2 или выше.

Приятного счета и спасибо за вашу поддержку! Команда Asteroids@home.

[Cyclops]

Space Sciences Laboratory, U.C. Berkeley

Американский ботнет что ли?

[Proga_Boinc]

Сообщение от Cyclops

Американский ботнет что ли?

нет

[Proga_Boinc]

Новые приложения OpenCL для графических процессоров AMD в проекте Asteroids@home!

https://asteroidsathome.net/boinc/fo...ead.php?id=967

Всем привет,

Мы с гордостью представляем наши новые приложения OpenCL для графических процессоров AMD!

Процесс разработки занял некоторое время, но нам наконец удалось его построить. Нам еще предстоит доработать много недоработок, но благодаря вам, ребята, и вашим отзывам мы продолжим улучшать код.

Для приложения Linux требуется 64-битная ОС с GLIBC v2.31 или выше, и оно будет работать на большинстве графических карт AMD Radeon и некоторых интегрированных графических процессорах AMD с поддержкой OpenCL 1.1 или выше.

Для приложения Windows требуется 64-битная версия Windows 10 или 11, и оно будет работать на большинстве карт AMD Radeon и некоторых интегрированных графических процессорах AMD с поддержкой OpenCL 1.2 или выше.

Приятного счета и спасибо за вашу поддержку! Команда Asteroids@home.

[Cyclops]

Сообщение от Proga_Boinc

нет

А много человечеству помог со своей печатной машинкой?

[Proga_Boinc]

Сообщение от Cyclops

А много человечеству помог со своей печатной машинкой?

Достаточно

[Proga_Boinc]

Сообщение от Cyclops

А много человечеству помог со своей печатной машинкой?

И кстати, это для тебя это печатная машинка, а для меня вах, машина зверь! ))

[Proga_Boinc]

«Есть кто-нибудь здесь?»

Скрытый текст:

«Есть кто-нибудь здесь?»

Астрономы ждут ответа от Альтаира

Автор: КАЗУКИ ЭНДО/штатный автор
https://www.asahi.com/ajw/articles/photo/47013614

НАГАНО – Астрономы с нетерпением ждут первого контакта разумной жизни с посланием, переданным в космос 40 лет назад.

Они надеются, что ответ с Альтаира, находящегося в 16,7 световых годах от Земли, вполне может прийти уже сейчас, учитывая относительную близость звездной системы и прошедшее время.

Символично, что наблюдатели за звездами решили, что 22 августа, когда 7 июля звездный фестиваль Танабата с участием небесных «любовников» Альтаира и Веги выпадает на лунный календарь, самое подходящее время для ожидания сообщения «оттуда». ».

Команда под руководством Синья Нарусавы из Университета Хёго развернёт антенну диаметром 64 метра в Саку, префектура Нагано, в надежде наблюдать радиосигналы в ответ на сообщение, отправленное в 1983 году.

Послание, состоящее из 13 рисунков, изображающих историю жизни на Земле, внешний вид людей и другую информацию, было создано астрономами Масаки Моримото и Хисаси Хирабаяси.

По словам Нарусавы, радиосигналы, изображающие эти рисунки, были переданы из Соединенных Штатов 15 августа 1983 года в рамках проекта космической тематики, посвященного 15-летию еженедельной антологии комиксов Shonen Jump.

Моримото, японский пионер в области, известной как поиск внеземного разума (SETI), работал в Токийской астрономической обсерватории Токийского университета, которая сейчас является частью Национальной астрономической обсерватории Японии.
Сейчас он умер.

Хирабаяси — почетный профессор Японского агентства аэрокосмических исследований. 58-летний Нарусава сказал, что где-то во Вселенной должна существовать разумная жизнь за пределами Земли.
«С 1990-х годов было обнаружено большое количество экзопланет», — сказал Нарусава, который также является исследователем SETI.
«У Альтаира может быть планета, окружающая среда которой может поддерживать жизнь».

Его команда будет тренировать антенну в Центре глубокого космоса Усуда JAXA в течение одного часа с 22:00. 22 августа.

В Танабате японцы молятся о том, чтобы пастух и ткач, любовники, разделенные в мифологии Млечным Путем, могли встретиться хотя бы раз в году, 7 июля.

Пастух представлен Альтаиром в созвездии Орла, а ткач отождествляется с Вега в созвездии Лиры.

В этом году Танабата выпадает на 22 августа по лунному календарю. В 1983 году, когда вопрос «Привет, есть кто-нибудь?» Послание было передано на небеса, оно вернется 15 августа.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc

[Proga_Boinc]

Космический телескоп Gaia и исследование длиннопериодических комет

Скрытый текст:

Космический телескоп Gaia и исследование длиннопериодических комет
Расчет долгопериодических орбит комет при одновременных галактических и звездных возмущениях. (Задача N тел с N порядка 400).
http://150.254.66.104/gaiaathome/img/aa38451-20.pdf

Изменения орбиты C/2002 T7, проецируемые на его исходную орбитальную плоскость, описанную пятью снимками в каталоге CODE. Красная линия показывает движение этой кометы в прошлом, а синяя линия — ее будущую эволюцию. Выделены пять эпох (снимков), когда регистрируются элементы орбиты:

1 - соприкасающаяся гелиоцентрическая орбита вблизи центра интервала наблюдений (обычно вблизи перигелия);
2 - зафиксированная в прошлом исходная барицентрическая орбита на расстоянии 250 а.е. от Солнца;
3 - будущая барицентрическая орбита, зафиксированная в будущем на расстоянии 250 а.е. от Солнца;
4 – предыдущая орбита, зафиксированная в предыдущем перигелии;
5 - следующая орбита, в данном случае зафиксированная на границе ухода на расстоянии 120 000 а.е. от Солнца, но для многих других комет зафиксированная в следующем перигелии.

Динамическая эволюция номинальной орбиты C/2002 T7 LINEAR (решение d6) при одновременных галактических и звездных возмущениях. Левая вертикальная ось описывает график гелиоцентрического расстояния (тонкие синие линии) и расстояния до перигелия (зеленые линии, которые становятся черными, если e превышает 1,0).

Правая вертикальная ось описывает угловые элементы (относительно плоскости диска Галактики): наклонение (линия цвета фуксии) и аргумент перигелия (красная линия). Тонкие линии описывают динамику, когда все звездные возмущения опущены.

Звездные приближения
http://150.254.66.104/gaiaathome/img/aa29835-16.pdf

Целью данной работы является исследование параметров близости и влияния тесного сближения звезд на основе Gaia DR2 и DR3. С помощью численного интегрирования в осесимметричной модели Галактики определены новые параметры тесного сближения звезд.

Добавляя десять тысяч клонов, нарисованных с помощью ковариационной матрицы, мы оцениваем наиболее вероятное положение и скорость звезд на минимальном расстоянии от Солнца.

подробнее: Берски Ф. и Дыбчински П.А., 2020: Параметры близкого сближения пересчитаны на основе первого выпуска данных Gaia.
Облако из 13517 клонов звезды Глизе 710, построенное по ковариационной матрице, взятой из каталога Gaia DR2.

Это облако проецируется на максимальную плоскость рассеяния X'Y', координаты выражены в парсеках. Красная точка — это положение Солнца, зеленая точка — номинальное положение звезды во время встречи, а оранжевый крест — центроид облака клонов. Синий пунктирный круг показывает приблизительную протяженность кометного облака Оорта. Параметры этой звезды известны с хорошей точностью, поэтому облако клонов довольно компактно.

Облако из 11327 клонов звезды ALS 9243, построенное по ковариационной матрице, взятой из каталога Gaia DR2.

Это облако проецируется на максимальную плоскость рассеяния X'Y', координаты выражены в парсеках. Красная точка — это положение Солнца, зеленая точка — номинальное положение звезды во время встречи, а оранжевый крест — центроид облака клонов.

Синий пунктирный круг показывает приблизительную протяженность кометного облака Оорта. Параметры этой звезды имеют низкую точность, но звезду необходимо детально изучить, поскольку она может иметь большую массу, даже более 10 масс Солнца. Gliese 710 пройдет мимо Солнца еще ближе.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
http://150.254.66.104/gaiaathome/about.php

[Proga_Boinc]

BOINC Census 2023
Welcome to the BOINC Census for 2023!

Добро пожаловать на перепись BOINC 2023 года!

Это проект, поддерживаемый Инициативой Science Commons (The SCI), направленный на улучшение текущего развития, пользовательского опыта, маркетинга и роста BOINC и его использования во всем мире.

Целью этого опроса является сбор общей анонимной информации о вас и о том, как вы используете BOINC. Мы не собираем адреса электронной почты или контактную информацию, а собираем только очень широкую демографическую информацию в этом опросе.

Результаты опроса будут опубликованы для всеобщего обозрения после завершения переписи. Все результаты будут анонимными.

Посмотреть результаты прошлого года можно здесь.

Мы рекомендуем вам поделиться этим опросом со всеми, кого вы знаете, кто использует BOINC, и отправить только один ответ в эту форму.

Если вы хотите получить уведомление, когда будет доступна следующая перепись, нажмите здесь.

https://forms.fillout.com/t/n33grsgkeRus
https://thesciencecommons.org/
https://mastodon.social/@the_sci
https://thesciencecommons.substack.com/

Спасибо за поддержку BOINC!

[Proga_Boinc]

Обновление исследования биомаркеров рака легких от команды MCM (ноябрь 2023 г.)

Скрытый текст:

Обновление исследования биомаркеров рака легких от команды MCM (ноябрь 2023 г.)

Мы продолжаем работу по характеристике биомаркеров рака легких, выявленных в рамках проекта MCM1. В этом обновлении основное внимание уделяется гену IL13RA1, связанному с выживаемостью при раке легких и дифференциально экспрессируемому при нескольких типах рака по сравнению с нормальными тканями.

https://www.worldcommunitygrid.org/r...m1/overview.do

Проект: Картирование маркеров рака

Опубликовано: 27 ноября 2023 г.

Фон

Распознавание закономерностей у онкологических больных может быть полезным, поскольку позволяет нам выявлять признаки рака у других пациентов или персонализировать лечение различных пациентов в соответствии с их генетическим профилем.

Проект Mapping Cancer Markers анализирует базы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком и саркомой, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогностические признаки.

С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали на проект более 867 200 лет процессорного времени, помогая анализировать данные исследований о различных типах рака значительно быстрее и более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны волонтерам, которые продолжают делать пожертвования на этот проект.

Мы продолжаем работу над общими биомаркерами рака легких. VAMP1, FARP1, GSDMB и ADH6 обсуждались в наших обновлениях за март, апрель, июль и сентябрь. Здесь мы излагаем информацию о IL13RA1.

Исследования IL13RA1
https://www.uniprot.org/uniprotkb/P78552/entry#function

IL13RA1, часть семейства рецепторов интерлейкина, кодирует субъединицу альфа-1 рецептора интерлейкина-13, которая вместе с IL4RA образует функциональный рецептор интерлейкина-13 (IL13) (Uniprot). Интерлейкины представляют собой тип цитокинов, которые экспрессируются различными клетками организма и играют важную роль в активации и дифференцировке иммунных клеток, а также в пролиферации, созревании, миграции и адгезии. Следовательно, будучи субъединицей рецептора IL13, IL13RA1 позволяет IL13 оказывать эти эффекты.

Учитывая его участие в иммунной функции, неудивительно, что была выявлена возможная связь между IL13RA1 и несколькими заболеваниями, включая ишемическую болезнь сердца[1], болезнь Паркинсона[2], язвенный колит[3], астму и другие аллергические заболевания[ 4,5,6]. IL13RA1 также был идентифицирован как синаптический белок, который участвует в пластичности и нейропротекции после травмы [7].

Как и другие представленные нами гены, мы исследовали роль IL13RA1 при раке легких и обнаружили, что он играет защитную роль, как показано на рисунке 1.

Рисунок 1. Кривые выживаемости пациентов с высокой и низкой экспрессией IL13RA1 (KMplotter).
https://kmplot.com/analysis/

Мы также исследовали, распространяется ли это открытие на другие виды рака. Как показано на рисунке 2, аналогичные тенденции в экспрессии IL13RA1 наблюдаются при большинстве протестированных видов рака.

В соответствии с этим наблюдением в литературе были документированы ассоциации между экспрессией IL13RA1 и раком поджелудочной железы[8], раком щитовидной железы[9], раком мочевого пузыря[10], раком молочной железы[11] и раком головного мозга[12].

Рисунок 2. Экспрессия IL13RA1 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).

Если у вас есть какие-либо комментарии или вопросы, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы могли ответить. Спасибо за вашу постоянную поддержку.
https://www.worldcommunitygrid.org/f...d_thread,45880

Рекомендации

Фэн X, Чжан Ю, Ду М, Ли С, Дин Дж, Ван Дж, Ван Ю, Лю П. Идентификация диагностических биомаркеров и терапевтических мишеней в периферическом иммунном ландшафте при ишемической болезни сердца. Джей Трансл Мед. 5 сентября 2022 г.; 20 (1): 399. дои: 10.1186/s12967-022-03614-1. PMID: 36064568; PMCID: PMC9444127.
Агирре К.А., Кончетта Морале М., Пэн К., Санчес-Алавес М., Синтрон-Колон Р., Фенг К., Фазелпур С., Махер П., Конти Б. Два однонуклеотидных полиморфизма в IL13 и IL13RA1 у лиц с идиопатической болезнью Паркинсона повышают восприимчивость клеток к окислительный стресс. Мозговой иммунитет. 2020 август;88:920-924. doi: 10.1016/j.bbi.2020.04.007. Epub, 7 апреля 2020 г. PMID: 32276028; PMCID: PMC9012133.
Гвигнер М., Мартинес-Нунес Р.Т., Уайток С.Р., Бонданезе В.П., Кларидж А., Коллинз Дж.Э., Каммингс Дж.Р.Ф., Санчес-Эльснер Т. МикроРНК-31 и микроРНК-155 сверхэкспрессируются при язвенном колите и регулируют передачу сигналов IL-13 путем нацеливания на интерлейкин 13 Рецептор α-1. Гены (Базель). 13 февраля 2018 г.;9(2):85. doi: 10.3390/genes9020085. PMID: 29438285; PMCID: PMC5852581.
Константинидис А.К., Бартон С.Дж., Сэйерс И., Ян И.А., Лордан Дж.Л., Рорк С., Клаф Дж.Б., Холгейт С.Т., Холлоуэй Дж.В. Исследования генетической ассоциации полиморфизмов гена субъединицы альфа1 рецептора интерлейкина-13 при астме и атопии. Eur Respir J. Июль 2007 г.;30(1):40-7. дои: 10.1183/09031936.00025706. Epub, 28 марта 2007 г. PMID: 17392323.
Фуруэ М., Улзи Д., Накахара Т., Цудзи Г., Фуруэ К., Хасимото-Хатия А., Кидо-Накахара М. Влияние IL-13Rα2 на атопическое воспаление кожи. Аллергол Инт. Июль 2020 г.;69(3):412-416. doi: 10.1016/j.alit.2020.01.005. Epub, 6 февраля 2020 г. PMID: 32037147.
Маккензи С.И., Варезе Н., Ауи П.М., Рейнвальд С., Уайнс Б.Д., Хогарт П.М., Тьен Ф., Хью М., Ролланд Дж.М., О'Хехир Р.Э., ван Зельм М.К. Секвенирование РНК одиночных аллерген-специфичных В-клеток памяти после иммунотерапии пыльцой трав: две уникальные судьбы клеток и CD29 как биомаркер эффекта лечения. Аллергия. Март 2023 г.;78(3):822-835. дои: 10.1111/all.15529. Epub, 1 октября 2022 г. PMID: 36153670.
Ли С, Олде Хеувел Ф, Рехман Р, Аусджи О, Фрелих А, Ли З, Джарк Р, Чжан В, Конквест А, Вулфле С, Шон М, О Меара CC, Рейнхардт РЛ, Фёрингер Д, Кассубек Дж, Людольф А, Хубер-Ланг М., Нёлль Б., Морганти-Коссманн М.К., Брокманн М.М., Бокерс Т., Розелли Ф. Интерлейкин-13 и его рецептор представляют собой синаптические белки, участвующие в пластичности и нейропротекции. Нац Коммун. 2023, 13 января;14(1):200. дои: 10.1038/s41467-023-35806-8. PMID: 36639371; PMCID: PMC9839781.
Ши Дж, Шен X, Кан Q, Ян X, Дензингер М, Корнманн М, Трауб Б. Потеря интерлейкина-13-рецептора-альфа-1 вызывает апоптоз и способствует ЕМТ при раке поджелудочной железы. Int J Mol Sci. 26 марта 2022 г.; 23 (7): 3659. doi: 10.3390/ijms23073659. PMID: 35409019; PMCID: PMC8998778.
Ван Б., Шен В., Ян Л., Ли X, Чжан Л., Чжао С., Цзинь X. Выявить потенциальный молекулярный механизм циркРНК, регулирующий мРНК, связанную с иммунитетом, через микроРНК губки в возникновении и иммунной регуляции папиллярного рака щитовидной железы. Энн Мед. 2023;55(2):2244515. дои: 10.1080/07853890.2023.2244515. PMID: 37603701; PMCID: PMC1044398.
Fang ZQ, Zang WD, Chen R, Ye BW, Wang XW, Yi SH, Chen W, He F, Ye G. Профиль экспрессии генов и пути обогащения на разных стадиях рака мочевого пузыря. Генет Мол Рез. 6 мая 2013 г.; 12 (2): 1479-89. doi: 10.4238/2013.Май.6.1. PMID: 23765955.
He M, Hu C, Deng J, Ji H, Tian W. Идентификация новой характеристики, связанной с гликолизом, для прогнозирования прогноза пациентов с раком молочной железы. World J Surg Oncol. 2 октября 2021 г.; 19 (1): 294. doi: 10.1186/s12957-021-02409-w. PMID: 34600547; PMCID: PMC8487479.
Морено Д.А., да Силва Л.С., Гомеш И., Леал Л.Ф., Берардинелли Г.Н., Гонсалвес ГМ, Перейра К.А., Сантана IVВ, Мацусита М.М., Бхат К., Лоулер С., Рейс Р.М. Иммунное профилирование рака раскрывает биомаркеры, иммунологические пути и оценку типов клеток, связанных с выживаемостью пациентов с глиобластомой. Тер Адв Мед Онкол. 21 декабря 2022 г.; 14: 17588359221127678. дои: 10.1177/17588359221127678. PMID: 36579028; PMCID: PMC9791289.

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc

[Proga_Boinc]

Обновление исследования Детского Рака от команды SCC (октябрь 2023 г.)

Команда Smash Childhood Cancer (SCC) поделилась обновленной информацией, продолжая проверять результаты.

Проект: Победить детский рак

Опубликовано: 30 октября 2023 г.

Фон

Проект Smash Childdhood Cancer (SCC) направлен на поиск лучших лекарств, воздействующих на ключевые молекулы, вызывающие рак у детей. Добровольцы World Community Grid по всему миру вложили в этот проект более 57 тысяч процессоро-лет. Благодаря их помощи команде удалось разработать лекарства от нескольких типов рака, таких как нейробластома (рак нервных тканей), гепатобластома (рак печени), остеосаркома (рак кости) и, совсем недавно, саркома Юинга.

Новости исследований SCC

Доктор Шефали Чаухан из cc-TDI продолжает проверять три новых соединения из исследований по моделированию CREB1, которые обладают перекрестной специфичностью к FLI1, структурированной половине белка EWSR1::FLI1 при саркоме Юинга.

Никита Розанов из cc-TDI и доктор Тюдзи Хосино из Университета Тиба обрабатывают результаты по Брахиурии (хордома), FLI1 (саркома Юинга), KLF15 (миоэпителиальная карцинома) и MyoD1 (склерозирующая и веретеноклеточная рабдомиосаркома), которые доктор Чаухан и его коллеги затем подтвердит.

Доктор Чарльз Келлер недавно представил дополнительную работу над PAX3/7::FOXO1, которая в настоящее время финансируется НИЗ, в качестве предварительных данных для проекта Cancer Research UK - NCI Grand Challenge стоимостью 25 миллионов долларов в сотрудничестве с Nurix Therapeutics и сетью академических сотрудников.

Благодарим команду SCC за то, что поделились с нами этим обновлением. В настоящее время рабочие подразделения SCC не будут доступны, поскольку команда сосредоточена на проверках предыдущего запуска. Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы могли ответить.
Команда WCG

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc

[Proga_Boinc]

Мы с гордостью сообщаем о нашем новом наборе оптимизированных приложений, которые будут использовать механизмы с поддержкой набора инструкций AVX512 или, точнее, те, которые поддерживают инструкции AVX512dq!

Эти приложения созданы для поддержки ОС Linux и Windows с 64-битной архитектурой. Разработка этой версии стала возможной благодаря огромной помощи команды Ахорека!
https://asteroidsathome.net/boinc/sh...hp?userid=3496

К сожалению, оказывается, что клиентские приложения BOINC для Windows по-прежнему не сообщают серверу все параметры процессора правильно. Это из-за известной ошибки, и даже после множества обсуждений на каналах BOINC она все еще существует. Хорошей новостью является то, что благодаря команде Ахорека исправление уже было принято и добавлено в репозиторий BOINC, и исправление будет применено после выпуска версии клиента 7.26.0. А до этого момента, чтобы запустить приложение AVX512, вам может потребоваться переключиться на анонимную платформу.

Мы хотели бы напомнить вам, что хотя сервер Boinc способен найти наиболее эффективное приложение для каждой конкретной системы с учетом множества факторов, через некоторое время он начнет отправлять подходящее приложение для каждой конкретной системы. Это означает, что даже если ваш процессор поддерживает инструкции AVX512dq, он все равно может получать задачи FMA или AVX, и вам не о чем беспокоиться. В таком случае вы можете попробовать так называемую анонимную платформу, где ваш клиент будет явно запрашивать приложение AVX512.
https://asteroidsathome.net/boinc/fo...ead.php?id=988

Приятного счета и спасибо за вашу поддержку!
Команда Asteroids@home

[Proga_Boinc]

Новогоднее соревнование на boincstats будет по отечественному проекту распределённых вычислений Gerasim@Home

Присоединяйте Ваши команды для увеличения вычислительных мощностей: https://www.boincstats.com/stats/cha...team/chat/1119

Добавлено через 15 часов 19 минут
Уважаемые участники SiDock@home.

Мы успешно достигли 21 важной вехи в нашей продолжающейся инициативе по открытию лекарств, и этот сильный, открытый и поддерживаемый сообществом проект по открытию лекарств продолжается.

В последнее время наши исследования были рутинными: виртуальный скрининг в одной и той же библиотеке на плеяду мишеней, связанных с короной. Однако эти усилия имеют решающее значение для развития наших исследований.

В настоящее время мы готовим публикации для двух наших завершенных задач (3CLpro и PLpro) и готовим почву для будущих целей по борьбе с наркотиками (здесь мы также планируем создать пул, в котором вы, участники, поможете нам принять решение о предстоящих целевых работах).

И последнее, но не менее важное: мы благодарим всех, кто пожертвовал криптовалюту или деньги. Сумма пожертвований на данный момент составляет 639 евро и 12 140 Gridcoin. Мы планируем использовать их для закупки препаратов и проведения скрининга in vitro. Как всегда, мы благодарны всем вам за ваш вычислительный вклад и обсуждения!

Мы с нетерпением ждем дальнейшей работы над SiDock@home.
С Рождеством всех и всего наилучшего Всем!
С наилучшими пожеланиями,
Наталья, Марко, Чртомир и Иней

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc

[Proga_Boinc]

Установка программного обеспечения Boinc

Скачать для Windows
Чтобы внести свой вклад в World Community Grid, при иследовании Рака, Онкологии, Диабета и других болезней, установите программное приложение BOINC.
1. Найдите БОИНК
Найдите загруженный установщик BOINC. Местоположение будет зависеть от вашего браузера, а имя вашего установщика будет содержать разные символы в конце имени файла.
2. Установите
Дважды щелкните, чтобы запустить установщик, а затем следуйте появляющимся подсказкам.
3. Начните вносить свой вклад
Поздравляем, теперь вы подключены к World Community Grid и готовы внести свой вклад! Просто продолжайте использовать свое устройство, как обычно, и World Community Grid использует вашу свободную энергию для научных исследований.
Загрузить программное обеспечение для Windows.
https://www.worldcommunitygrid.org/download
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru

[Proga_Boinc]

НОВОЕ УЛУЧШЕННОЕ ПРИЛОЖЕНИЕ «ГРАВИТАЦИОННАЯ ВОЛНА»

Скрытый текст:

НОВОЕ УЛУЧШЕННОЕ ПРИЛОЖЕНИЕ «ГРАВИТАЦИОННАЯ ВОЛНА» И СПЕЦИАЛЬНОЕ ПОЗДРАВЛЕНИЕ С НОВЫМ 2024 ГОДУ
Отправлено 16 января 2024 г.
Дорогие кранчеры!

Мы хотели бы поделиться с вами двумя вещами:

а) приложение GW с ускорением на графическом процессоре теперь гораздо менее требовательно к памяти и с меньшей вероятностью выдает ошибки. Если вы ранее отказались от приложения GW, мы приглашаем вас пересмотреть свое решение и дать шанс новой версии.

б) чтобы отметить выпуск нового приложения, у нас есть специальное праздничное предложение для наших волонтеров: вы получите в два раза больше кредитов BOINC за результаты в приложении GW.

[подробности смотрите в теме форума]

https://einsteinathome.org/ru/conten...oved-gravitati...
В последнее время мы были заняты улучшением процесса обработки данных при запуске поиска гравитационных волн по всему небу O3 по данным O3 (поиск O3ASHF).

Мы заметили, что некоторые вещи были не совсем оптимальными: изначально приложению требовалось почти 4 ГБ памяти на вашей видеокарте, что, по общему признанию, было слишком амбициозным. Мы заметили, что многие результаты возвращаются к нам в виде ошибок вычислений, вызванных ошибками распределения памяти.

Мы также заметили, что довольно много пользователей отказались от приложения Gravitational Wave, и мы подозреваем, что в этом виноваты относительно высокий уровень ошибок и высокие требования к памяти. Приносим извинения за возможные неудобства.

Поэтому мы существенно изменили рабочие модули и приложение: вместо того, чтобы обрабатывать определенный объем пространства параметров за один раз для каждого рабочего модуля (и использовать для этого почти 4 ГБ видеопамяти), новое приложение будет работать на рабочих модулях, которые выполняют поиск в том же пространстве. но в два этапа последовательно, каждый раз охватывая половину предыдущего объема поиска. Преимущество состоит в том, что теперь максимальный объем видеопамяти, используемый для этого, составляет всего около 2 ГБ, и чтобы создать некоторый запас безопасности, мы позволяем BOINC принять требование примерно в 2,5 ГБ.

Новая версия приложения была развернута некоторое время назад, и мы действительно наблюдаем существенное уменьшение количества рабочих единиц, завершающих работу с ошибкой, поэтому все работает так, как задумано.

Важно: если вы ранее отказались от поиска по гравитационным волнам в пользу ускоренного поиска с помощью графического процессора BRP7, мы хотели бы предложить вам снова включить поиск GW в ваших настройках (в разделе «Проект»: обратите внимание, что вы возможно, вы захотите установить это во всех «местах» BOINC).

С Новым 2024 годом!

Дополнительные кредиты

В качестве стимула попробовать новое приложение (особенно если вы ранее отказались от него) и в качестве компенсации за потенциальные проблемы в прошлом мы увеличили количество кредитов за новые рабочие единицы, генерируемые с этого момента, до 10 тысяч, что в два раза превышает предыдущую сумму. . Некоторые дополнительные технические примечания Если у вас есть видеокарта с 4 ГБ видеопамяти или меньше, вы, вероятно, захотите убедиться, что вы случайно не запустите два или более экземпляров приложения одновременно.

В этом случае «Коэффициент использования графического процессора» в настройках вашего проекта в BOINC должен быть установлен на 1,0, что является значением по умолчанию. Если вы уменьшили это значение до 0,5 и т. д., чтобы разрешить параллельное использование нескольких устройств в прошлом, и вы видите ошибки в вычислениях (потому что BOINC попытается запустить два устройства с общим использованием ОЗУ, очень близким к 4 ГБ, потому что BOINC обманут низким объемом видеопамяти). использования в самом начале приложения), вам следует установить значение 1.0. Приятного хруста!

[Proga_Boinc]

Дорогие друзья, мы получили результаты для различных целей SARS-CoV-2. Вычисления продолжаются, и мы хотим узнать ваше мнение о следующей цели. Проголосовать за одного из них можно до 5 февраля 2024 года.

Дальнейшие исследования основной протеазы SARS-CoV-2 (3CLpro)
Это важнейшая терапевтическая мишень против SARS-CoV-2. 3CLpro (цистеиновая протеаза; EC 3.4.22.69), в частности, имеет решающее значение для расщепления полипротеинов коронавируса с образованием зрелых неструктурных белков, которые сами по себе необходимы для механизмов репликации вируса. Нам все еще нужно гораздо больше исследований по этой цели в поисках новых, более мощных ингибиторов.

Гликопротеин вируса Эбола (GP).
Вирус Эбола является опасным патогеном для человека, и эта мишень может стать идеальным примером для исследования сценария разработки лекарств типа ИПП. Гликопротеин EBOV (GP) является единственным экспрессируемым вирусом белком на поверхности вириона и имеет решающее значение для прикрепления к клеткам-хозяевам и катализа слияния мембран.

Коронавирус синдрома острой диареи свиней (SADS-CoV PLpro).
Эта цель позволит нам изучить дизайн на нескольких связанных вирусных мишенях. Коронавирус синдрома острой диареи свиней (SADS-CoV), недавно появившийся кишечный коронавирус, считается связанным с синдромом острой диареи свиней (SADS), который нанес значительный экономический ущерб свиноводству. Патоген указывает на потенциал перехода к хозяину.

https://www.sidock.si/sidock/forum_t...hp?id=268#2178

Голосование: https://www.sidock.si/sidock/poll_vo...17062725491122

[Proga_Boinc]

Обновление исследования от команды OPN (февраль 2024 г.)

Команда Open Pandemics выпустила новые рабочие модули, нацеленные на ДНК-полимеразу цитомегаловируса.

Проект: OpenPandemics - COVID-19 Опубликовано: 14 февраля 2024 г.
https://www.worldcommunitygrid.org/r...n1/overview.do

Терминология
- ДНК-полимераза: фермент, состоящий из нескольких субъединиц, который строит ДНК путем сборки нуклеотидов.

Фон
https://www*****ipps.edu/

Ученые из Scripps Research проводят молекулярное моделирование, чтобы найти возможных кандидатов для разработки методов лечения вирусов, включая COVID-19. Это исследование требует огромных вычислительных мощностей для проведения миллионов смоделированных лабораторных экспериментов. Молекулы, идентифицированные как многообещающие кандидаты, затем проверяются в лабораториях сотрудниками команды OPN.

Обновление рабочего подразделения

Новые исследовательские подразделения нацелены на ДНК-полимеразу цитомегаловируса, распространенного вируса, который особенно вреден для беременных или людей с ослабленным иммунитетом. Цель состоит в том, чтобы идентифицировать малые молекулы, связывающиеся с одной из субъединиц полимеразы, предотвращая ее взаимодействие с другой субъединицей полимеразы и тем самым нарушая сборку функциональной полимеразы. Около 40 миллионов молекул энамина будут смоделированы для выявления кандидатов для исследования и оценки нашими сотрудниками.

Рисунок 1. Цитомегаловирусная инфекция пневмоцитов (автор изображения: доктор Йель Розен, США. Изображение доступно по лицензии Creative Commons Attribution-Share Alike 2.0 Generic Licence)
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/2.0/

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc

[Proga_Boinc]

Конкурс вычислений Moonshoot

Скрытый текст:

Конкурс вычислений Moonshoot

Мы рады объявить о конкурсе, поощряющем старшеклассников изучать науку о данных и распределенных вычислениях с использованием BOINC и World Community Grid.

Опубликовано: 22 февраля 2024 г.

Как мы отмечали в нашем информационном бюллетене за октябрь 2023 года, мы работаем над установлением более прочной связи со средними школами. Мы рады объявить о конкурсе, поощряющем старшеклассников изучать науку о данных и распределенных вычислений с использованием BOINC и World Community Grid.

Конкурс Computation Moonshoot призван помочь студентам внести свой вклад в реальные, полезные результаты для исследователей в захватывающей конкурентной атмосфере. Конкурс организован The Science Commons Initiative и пройдет с 25 марта по 7 мая 2024 года. Хотя основной конкурс открыт для всех средних школ США и их учащихся, мы надеемся, что это вызовет некоторый глобальный интерес.

Призы будут вручены школе, внесшей наиболее активный вклад, школе, вложившей больше всего времени на обработку, и школе с самым высоким соотношением активных участников к учащимся. Призы варьируются от научного оборудования до подарочных карт и студенческих стипендий.

Это соревнование — не первое соревнование по грид-вычислениям, проводимое на WCG.

В 2019 году Стокгольмская школа науки и инноваций в Швеции провела соревнование между 5 командами, вложившими более 25 лет ЦП и 45 945 результатов за один месяц в проекты MCM и MIP.

Еще один из наших партнеров по средней школе, средняя школа Сислера в Канаде, приняла участие в Compute for the Cure 2021, двухнедельном конкурсе пожертвований MCM, вернув 52 392 результата и заняв второе место в конкурсе. Они также провели свои собственные внутришкольные соревнования. Обе средние школы отметили, что соревнования предоставляют учащимся ценную возможность обучения и являются интересным способом мотивировать учащихся к использованию грид-вычислений. В эту растущую группу наших партнеров из средних школ входит средняя школа сообщества Бока-Ратон, которая создала клуб WCG и расширяет учебную программу по естественным наукам, изучая проекты WCG, программирование и высокопроизводительные вычисления.

Мы с нетерпением ждем конкурса Computation Moonshot и возможностей, которые он предоставит для обогащения обучения студентов. Регистрация на этот конкурс уже открыта. Для получения дополнительной информации о конкурсе и о том, как зарегистрироваться, посетите веб-сайт Computation Moonshoot. https://computationmoonshot.org/?page_id=16
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=793
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=787
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=601
http://thesciencecommons.org/
https://computationmoonshot.org/?page_id=16
https://www.worldcommunitygrid.org/i...r_Oct_2023.pdf

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc

[Proga_Boinc]

Обновление исследования от команды MCM (март 2024 г.)

Скрытый текст:

Обновление исследования от команды MCM (март 2024 г.)

Мы продолжаем характеризовать биомаркеры рака легких, выявленные в проекте MCM1. Это обновление посвящено HSD17B11, гену, связанному с выживаемостью при раке легких. HSD17B11 представляет собой ген, кодирующий белок, относительно повсеместно экспрессирующийся в органах и тканях. Это короткоцепочечная алкогольдегидрогеназа, которая метаболизирует вторичные спирты и кетоны.

Проект: Картирование маркеров рака Опубликовано: 14 марта 2024 г.

Терминология

- Стероидогенез: процесс, посредством которого холестерин превращается в различные стероидные гормоны.
- Идиопатическая необструктивная азооспермия: наиболее тяжелый тип мужского бесплодия, характеризующийся малым объемом яичек и очень низкой концентрацией сперматозоидов, причина которого не установлена.
Фон

Идентификация молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур) позволяет нам выявлять заболевание на более ранней стадии (диагностические сигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе закономерностей прогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры), что потенциально может привести к определению того, какие пациенты могут получить пользу от различных вариантов лечения (прогностические сигнатуры). . Проект Mapping Cancer Markers анализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком и саркомами, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогностические признаки.

С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали проекту более 894 000 лет процессорного времени, помогая анализировать данные о раке и саркоме легких и яичников гораздо более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.

Далее описывая 26 генов с наибольшим количеством баллов при раке легких, мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB, AHD6, IL13RA1, PCSK5 и TLE3 в предыдущих обновлениях MCM. Здесь мы излагаем информацию о HSD17B11. Важно отметить, что на данный момент между всеми этими белками существует сильная связь, как показано на рисунке 1. HSD17B11 является четвертым по количеству связанных белков в нашем списке, при этом FARP1, TLE3, PCSK5 являются более связанными.

Рисунок 1. Физические взаимодействия белков, связывающие 8 белков, на которых мы сосредоточились до сих пор (розовые узлы). Данные из нашей базы данных IID.

HSD17B11 Исследования

HSD17B11 — это ген, который кодирует белок, называемый гидроксистероид-17-бета-дегидрогеназа 11. Гидроксистероид-17-бета-дегидрогеназа 11 может превращать андростан-3-альфа,17-бета-диол в андростерон in vitro, что позволяет предположить, что он может участвовать в выработке андрогена.

Учитывая его структуру (рис. 2), HSD17B11 имеет четыре известных лиганда, которые могут с ним связываться, включая андростерон, глицерин, сульфат-ион и хлорид-ион.

Рисунок 2. Структура белка HSD17B11 (PD.

Крупный метаанализ показал, что однонуклеотидные полиморфизмы в HSD17B11 в значительной степени связаны с мышечной массой тела [1]. Также было обнаружено, что HSD17B11 является потенциальным биомаркером ишемической болезни сердца [2] и идиопатической необструктивной азооспермии [3].

Было обнаружено, что HSD17B11 играет защитную роль при раке легких (рис. 3), как и другие гены, которые мы представили до сих пор.
Рисунок 3. а) Кривые выживаемости пациентов с низкой и высокой экспрессией HSD17B11 (KMplot). б) Еще более сильная связь обнаружена для аденокарциномы легких и в) для никогда не куривших.

Мы продолжили исследования, чтобы изучить связь между HSD17B11 и другими видами рака. Как показано на рисунке 4, при сравнении раковых тканей и нормальных тканей, HSD17B11 дифференциально экспрессируется при большинстве видов рака (обозначено красным текстом).

При большинстве видов рака его активность повышена, за исключением рака молочной железы, толстой кишки, плоскоклеточного рака легких, рака яичников, почек, щитовидной железы и матки. В литературе HSD17B11 связан с прогнозом рака простаты [4] и выживаемостью при раке поджелудочной железы [5].

Рисунок 4. Экспрессия HSD17B11 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).

Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили!

Команда WCG
https://www.worldcommunitygrid.org/f...ffset,0#695182

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.ru