Нашел идеальный способ починить для себя концовку.
http://www.youtube.com/watch?v=vhxBRmvq6QY
А вся бодяга с мальчиком - околосмертные глюки Шепарда, включая мотивы жнецов. При выборе дестроя Шепард старается вернуться к реальности, а в двух других вариантах умирает мечтая о лучшем мире.